Zeytinyağının kalitesini korumak için şişeleme ve paketleme süreci büyük önem taşır. Koyu renkli cam şişeler, ışığın yağa zarar vermesini önler. Şişelerin hava geçirmez kapaklarla kapatılması oksidasyonu engeller. Modern paketleme tekniklerinde vakumlu kapaklar, alüminyum folyo ve özel kaplamalar kullanılır. Plastik ambalajlar genellikle tercih edilmez çünkü yağın tadını bozabilir ve ışık geçirir. Ayrıca, ambalaj tasarımında ürünün menşei, üretim tarihi, asitlik oranı gibi bilgiler şeffaf ve tüketici dostu şekilde sunulur. Böylece hem ürün korunur hem de tüketici bilinçlendirilir.