Zeytinyağı, ambalajlandıktan sonra hem iç pazara hem de uluslararası pazarlara gönderilmek üzere çok hassas bir lojistik süreçten geçer. Ürünün ışık, ısı ve oksijenle teması kalite kaybına neden olabileceğinden, taşımacılık sırasında bu faktörlerin minimize edilmesi gerekir. Ayrıca, hava şartlarına bağlı olarak sıcaklık dalgalanmaları zeytinyağının bozulma riskini artırabilir. Ambalajın sağlamlığı, sızıntı yapmaması ve kolay taşınabilir olması da lojistik süreçte önemlidir. Uluslararası taşımacılıkta, gümrük işlemleri, kalite belgeleri ve menşe etiketi gibi evraklar da dikkatle hazırlanmalıdır. Özellikle Avrupa Birliği, ABD ve Japonya gibi pazarlarda, ithalat standartları oldukça sıkıdır ve analiz raporları talep edilir. Bu nedenle üreticiler, depolama, etiketleme ve lojistik süreçleri konusunda profesyonel firmalarla çalışmayı tercih eder. Lojistik aynı zamanda maliyet üzerinde doğrudan etkilidir. Doğru planlanmayan dağıtım, ürünün raf ömrünü kısaltabilir ve müşteri memnuniyetini olumsuz etkileyebilir.